Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM4Q9C037 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms