Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms