Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HIRIP3Q9BW71 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HIRIP3Q9BW71 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HIRIP3Q9BW71 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HIRIP3Q9BW71 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HIRIP3Q9BW71 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HIRIP3Q9BW71 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HIRIP3Q9BW71 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HIRIP3Q9BW71 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HIRIP3Q9BW71 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HIRIP3Q9BW71 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HIRIP3Q9BW71 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HIRIP3Q9BW71 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
HIRIP3Q9BW71 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HIRIP3Q9BW71 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
HIRIP3Q9BW71 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HIRIP3Q9BW71 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
HIRIP3Q9BW71 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HIRIP3Q9BW71 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HIRIP3Q9BW71 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HIRIP3Q9BW71 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HIRIP3Q9BW71 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HIRIP3Q9BW71 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HIRIP3Q9BW71 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
HIRIP3Q9BW71 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HIRIP3Q9BW71 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
HIRIP3Q9BW71 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
HIRIP3Q9BW71 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HIRIP3Q9BW71 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms