Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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SHANK2-AS3Q9BTD1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SHANK2-AS3Q9BTD1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SHANK2-AS3Q9BTD1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SHANK2-AS3Q9BTD1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SHANK2-AS3Q9BTD1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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SHANK2-AS3Q9BTD1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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