Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms