Protein–RNA interactions for Protein: Q99986

VRK1, Serine/threonine-protein kinase VRK1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VRK1Q99986 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VRK1Q99986 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms