Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms