Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD27Q96NW4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms