Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms