Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2E2Q96LR5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms