Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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