Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 AC034187.1-201ENST00000437047 561 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 KCTD14-202ENST00000533144 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 AL121694.1-201ENST00000554253 671 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 AC010834.3-201ENST00000520562 939 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 AL136115.1-201ENST00000447478 517 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 FCAR-203ENST00000355524 1483 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms