Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms