Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC35A4Q96G79 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms