Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms