Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYTL4Q96C24 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYTL4Q96C24 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SYTL4Q96C24 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYTL4Q96C24 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYTL4Q96C24 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SYTL4Q96C24 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYTL4Q96C24 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYTL4Q96C24 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYTL4Q96C24 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms