Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms