Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX21Q969T3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms