Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms