Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUM0

NUP133, Nuclear pore complex protein Nup133, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP133Q8WUM0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP133Q8WUM0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP133Q8WUM0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP133Q8WUM0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms