Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms