Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNNM3Q8NE01 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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