Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBP5

MFSD9, Major facilitator superfamily domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD9Q8NBP5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD9Q8NBP5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms