Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SKAP1Q86WV1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms