Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHA9Q7RTU4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms