Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms