Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms