Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms