Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms