Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED9Q6R2W3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
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