Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms