Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms