Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms