Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HDGFL1Q5TGJ6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDGFL1Q5TGJ6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms