Protein–RNA interactions for Protein: Q5TG30

ARHGAP40, Rho GTPase-activating protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP40Q5TG30 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARHGAP40Q5TG30 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms