Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms