Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms