Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms