Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC39A12Q504Y0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms