Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms