Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC27Q2M243 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms