Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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