Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms