Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UPP1Q16831 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms