Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2B3Q16720 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2B3Q16720 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2B3Q16720 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2B3Q16720 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2B3Q16720 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2B3Q16720 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2B3Q16720 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2B3Q16720 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2B3Q16720 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2B3Q16720 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2B3Q16720 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2B3Q16720 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2B3Q16720 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2B3Q16720 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2B3Q16720 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
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