Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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ECM1Q16610 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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ECM1Q16610 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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ECM1Q16610 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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ECM1Q16610 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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ECM1Q16610 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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ECM1Q16610 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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ECM1Q16610 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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ECM1Q16610 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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ECM1Q16610 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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ECM1Q16610 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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ECM1Q16610 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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ECM1Q16610 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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