Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
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GABRA6Q16445 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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GABRA6Q16445 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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GABRA6Q16445 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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GABRA6Q16445 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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GABRA6Q16445 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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GABRA6Q16445 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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GABRA6Q16445 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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GABRA6Q16445 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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GABRA6Q16445 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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