Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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SSX1Q16384 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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SSX1Q16384 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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SSX1Q16384 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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