Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF2Q15853 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF2Q15853 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF2Q15853 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF2Q15853 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
USF2Q15853 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF2Q15853 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF2Q15853 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF2Q15853 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF2Q15853 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF2Q15853 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF2Q15853 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF2Q15853 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF2Q15853 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF2Q15853 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF2Q15853 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF2Q15853 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
USF2Q15853 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF2Q15853 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF2Q15853 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF2Q15853 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF2Q15853 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF2Q15853 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF2Q15853 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF2Q15853 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF2Q15853 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF2Q15853 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF2Q15853 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
USF2Q15853 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF2Q15853 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF2Q15853 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF2Q15853 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF2Q15853 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF2Q15853 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF2Q15853 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
USF2Q15853 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF2Q15853 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
USF2Q15853 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF2Q15853 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
USF2Q15853 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF2Q15853 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF2Q15853 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF2Q15853 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF2Q15853 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF2Q15853 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF2Q15853 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF2Q15853 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF2Q15853 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF2Q15853 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF2Q15853 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF2Q15853 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF2Q15853 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF2Q15853 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF2Q15853 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF2Q15853 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF2Q15853 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF2Q15853 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF2Q15853 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF2Q15853 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF2Q15853 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF2Q15853 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF2Q15853 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF2Q15853 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF2Q15853 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF2Q15853 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF2Q15853 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF2Q15853 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF2Q15853 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
USF2Q15853 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF2Q15853 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF2Q15853 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF2Q15853 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF2Q15853 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF2Q15853 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF2Q15853 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF2Q15853 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF2Q15853 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF2Q15853 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF2Q15853 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF2Q15853 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF2Q15853 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
USF2Q15853 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF2Q15853 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF2Q15853 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF2Q15853 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF2Q15853 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF2Q15853 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF2Q15853 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF2Q15853 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF2Q15853 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USF2Q15853 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USF2Q15853 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USF2Q15853 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USF2Q15853 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USF2Q15853 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USF2Q15853 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USF2Q15853 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USF2Q15853 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USF2Q15853 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USF2Q15853 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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