Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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